BIOINFORMÁTICA

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INICIO
3 de mayo de 2013

DURACIÓN
50 horas

HORARIO
De lunes a viernes 18 a 21 h.

PROGRAMA

1. Introducción a la bioinformática (5h)
  - Intentando definir la bioinformática
  - Relevancia actual de la bioinformática
  - Formatos de ficheros y bases de datos
  - Proveedores institucionales de datos
  - Herramientas locales y de internet

2. Herramientas computacionales (24h)
  - Sistemas operativos alternativos: introducción a unix/linux
  - Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes)
  - Lenguajes de programación: Perl como ejemplo
  - Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl
  - Herramientas estadísticas: R como ejemplo
  - Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo
  - Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo
  - Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos

3. Algoritmos (6h)
  - Búsqueda de patrones en secuencias
  - Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica
  - Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal

 
4. Bioinformática aplicada (15h)
  - Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST)
  - Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones)
  - Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR)
  - Minería en datos masivos (high throughput screening)
  - Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO)

  - Análisis de la variación (polimorfismos)
  - Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias)
  - Biología estructural tridimensional: PDB